鹅口疮治疗主要有药物治疗，用制霉菌素、或5%碳酸氢钠进行治疗，同时注意卫生，尤其是口腔卫生。
一、可以使用制霉菌素进行治疗。把制霉菌素碾成粉末，加入香油混合，制成混悬液，涂抹在有白色膜状物部位。只要有白色的膜状物的部位都要涂抹，一般涂抹2到3天，这种膜状物就会明显缓解了，甚至消失了。这个时候仍然需要继续涂抹三天以上，可以有效的减少鹅口疮的复发。
二、可以使用5%的碳酸氢钠，加入生理盐水稀释，一般是1:1稀释的。稀释以后可以涂抹在这些白色膜状物的地方。如果对于大孩子，可以让大孩子在饭前饭后漱口，也能够有效治疗鹅口疮。两种药物如果联合，也就是制霉菌素和5%的碳酸氢钠稀释液联合使用，效果是更好的。
平时也要注意卫生，这是非常关键的，如果只用药不注意卫生，也容易导致鹅口疮的反复发作。要注意玩具、毛巾、奶瓶、奶嘴、尿布等东西，必须要及时的、定期的进行消毒处理。要注意宝宝的口腔卫生，宝宝在吃奶前、吃奶后要做好口腔清洁卫生，可以有效的预防和治疗鹅口疮。