多囊卵巢患者在做完卵巢打孔术之后有一定的概率会出现一些后遗症，包括：1.卵巢提早衰老，如果手术时技术不过关就会影响卵巢的血液供应，可能会引起卵巢早衰；2.在卵巢打孔术的时候可能会引起手术粘连进而造成医源性不孕；3.在手术中麻醉可能会引起其他的风险。

多囊卵巢打孔手术能够降低雄激素水平，从而促使卵泡发育成熟，引起自发排卵，治疗不孕，因此有生育需求的女性，可以在医生的建议下选择腹腔镜打孔手术，而对于没有生育需求的患者是不用做手术的，建议进行保守治疗。但是多囊卵巢打孔术后遗症让患者十分的担心。
　　多囊卵巢打孔术是指腹腔镜下的卵巢电灼或激光打孔手术，过手术能够破坏了卵巢间质的卵泡膜和间质细胞，穿刺卵泡后，卵泡液流出使血清雄激素（T）水平降低，减少或消除了原卵泡中雄激素的影响，促进排卵。
　　多囊卵巢腹腔镜打孔手术相比其他传统手术创伤小，发生后遗症的几率是相当低的。但是后遗症发生概率与麻醉、消毒、手术设备、技术等相关，如果选择了一些消毒不到位、设备、技术落后的不正规医疗点时，风险会增大，后遗症发生概率会增高。
　　多囊卵巢患者腹腔镜卵巢钻孔术存在一定的风险。如果手术技术不熟练，会影响卵巢的血液供应，因此有可能导致卵巢早衰和绝经提前。手术粘连腹腔镜卵巢钻孔术也可能引起手术粘连，从而引起医源性不孕。其他风险腹腔镜卵巢钻孔术虽然简单易行，但与传统的开腹手术相比，手术和麻醉可能会引起其他风险和并发症，创伤相对较小，因此不会影响手术后的美观。而且恢复较快，术后几天即可出院，基本不影响生活和工作。
　　此项手术比较简单，手术过程还可了解盆腔及输卵管是否正常，还可发现合并一些其他的因素从而可以进行有针对性的治疗。手术可以比较理想的降低卵巢综合征的发生率。如果过量使用传统的药物会形成卵巢过度的刺激，导致短时期内的卵巢体积迅速增大，甚至到原来的五倍，严重的话会伴有胸水、腹水，如果再严重还会出现循环衰竭，甚至再严重会导致病人残废、死亡。这就是所说的卵巢过度刺激综合征。而多囊卵巢打孔术则完全可以避免这种情况的出现，所以说手术相对是比较安全的。